本实用新型涉及一种开放式、可重构水下机器人控制系统，控制系统包括：水面系统和设置在水下机器人上的水下系统；水面系统包括：接收用户操作信息的用户操作接收装置；与用户操作接收装置连接的水面接口；水下系统包括：根据用户操作信息生成控制水下机器人航向的控制指令的航行控制器；与航行控制器连接，并根据控制指令驱动水下机器人的动力控制装置；分别与水面接口、航行控制器连接的水下接口。本实用新型实施例通过将将水下机器人控制系统进行区块划分，使得水下机器人可以根据用户操作信息进行数据处理，生成控制水下机器人航向的控制指令，使得水下机器人按照用户的操作信息进行航行作业。