一种液化天然气运输船船舱的预冷工艺，采用以下步骤：一：使用天然气对数个液化天然气运输船船舱的惰化气体进行置换；二：使用低温天然气对液化天然气运输船的数个船舱进行初始预冷；三：在低温天然气冷却的最后阶段，重复二对液化天然气运输船的数个船舱进行深冷；深冷时，所产生的天然气量不仅可控，对船舱冷却操作安全；而且，数个船舱所产生的气体能够被接收站冷凝器或液态天然气蒸发气压缩机回收或外输。本发明不仅在液化天然气接收站终端实现预冷作业；而且，还在液化天然气运输船船舱预冷过程中，不影响接收站正常生产，实现了液化天然气运输船船舱冷却液态天然气蒸发气零排放，解决了液化天然气浪费和对船舱本身可能造成损伤的问题。