本发明公开了一种入水口除污装置、喷水推进器及除污方法，属于船舶技术领域。本发明所提供的入水口除污装置包括过滤结构、梳齿结构和驱动机构。通过在入水口设置过滤结构，能够避免体积较大的污物从入水口进入，通过在过滤结构上设置梳齿结构，并通过驱动机构驱动梳齿结构沿过滤结构做往复运动，能够将堵塞在过滤结构上的污物清理干净，从而避免污物堵塞入水口。此外，由于该梳齿结构的移动轨迹覆盖入水口，因此该除污装置清理效果好，且梳齿结构的往复运动清理污物的清理效果高。