本发明公开了一种双体船舶子弹尾结构的加工方法，包括以下步骤：(1)放样与号料；(2)加工与开坡口；(3)装配与焊接：在平直钢板上，将子弹尾所用部件的装配与船主体的装焊相结合，以子弹尾内部的纵向构件与船体尾部的底部强力构件作可靠的连接，子弹尾内部的强力纵向构件在与主船体毗邻的舱内延伸2个肋位，子弹尾的外板与船尾底板、舭板作双面连续焊，并保持外板的光顺性；当对子弹尾外板与毗邻的船体外板厚度差值≥4mm，则在装配前将较厚的子弹尾外板边缘削斜，削斜宽度≥厚度差的4倍；(4)外形打磨。本发明能够减少子弹尾纵向变形，降低曲率变化，焊接变形小，减少子弹尾结构使用过程中的损害，具有广泛的市场推广价值。