本发明公开了一种水中航行器的自救系统，包括救生气囊，救生气囊设置在船体侧板内侧和/或外侧的救生舱内，且救生舱与船舱内部隔离，救生气囊与设置在救生舱内若干根呈折叠状相互铰接的连杆连接，若干根连杆中第一根连杆的一端与救生舱的舱体铰接，第一根连杆的另一端与第二根连杆的一端铰接，若干根连杆中最后一根连杆的一端与气囊的外边缘固定连接，其余连杆均与气囊之间通过绳索连接，救生舱在船体侧板上设有救生舱门；救生状态下通过设置在船体上的控制器控制救生舱门开启，控制气泵给救生气囊充气，充气后的救生气囊与若干根连杆一起伸出船体外。该水中航行器的自救系统具有结构简单、使用便捷、救生效果好，可避免船舶沉默的特点。