本发明提供了一种船用太阳能风帆的智能控制器及控制方法，用于控制风帆攻角与风帆姿态。该智能控制器包括太阳能风帆、滚珠丝杆及配套齿轮齿条、直流减速电机、电机驱动器，风帆起落装置，其特征是还包括正交编码器、行程开关、风速仪、风向仪、辐照传感器、GPRS模块、GPS模块以及微控制装置。本发明通过实时采集水上环境参数，查询当地气象历史数据，由智能控制器中的算法决策输出至电机驱动器，驱动直流减速电机控制风帆收放和帆角调节。本发明可以实现风能和太阳能的高效最优利用。