本实用新型公开了一种小型船舶货油驳运系统，包括位于主甲板上的至少一条第一输油管路以及位于泵舱内的第二输油管路、第三输油管路和第四输油管路；第二输油管路包括通过输油管依次连接的第一截止阀、滤器、第二截止阀、货油泵和第三截止阀；第三输油管路上设有第四截止阀，其输油管的两端分别连接至位于货油泵与第三截止阀之间的输油管上和位于过滤器与第二截止阀之间的输油管上；第四输油管路上设有第五截止阀其两端分别连接至位于货油泵与第二截止阀之间的输油管上和位于第三截止阀和第六截止阀之间的输油管上；该货油驳运系统结构简单，通过调整各个截止阀的开闭状态即可实现供油功能和供油完成后的自清扫功能，避免余油留存和拆卸时溢出。