本发明公开了一种无人船水质取样装置，若干根所述硬管分层设置在船体上，且相邻地两根硬管之间通过软管密封连接，牵引绳由上至下依次穿设于所述硬管上，且牵引绳的顶端与牵引电机相连，底端与铅锤相连，最顶层的硬管与最底层的硬管均与牵引绳之间固定连接；输水管的一端与最顶层的硬管密封连接，另一端置于样品存储单元的上方，样品存储单元连接在船体上，水泵连接在输水管上。本发明结构简单，能够根据不同的水域状况以及取样深度来更换不同的取样水管和取样瓶，更换简单易于操作。可以多次取样，同时避免取样样本污染等问题，确保取样的多样性。