本发明公开了一种船舶轴段进舱导向工装及使用方法，所述船舶轴段进舱导向工装包括导向头和延长杆，所述导向头的两端面的直径不同，所述导向头直径较大的一端的端面的中心设有第一凸台，所述第一凸台的外表面设有与轴段配合的外螺纹，所述导向头直径较小的一端固定连接所述延长杆，所述导向头的中部周向均布有多个用于将所述导向头与所述轴段配合拧紧的拧紧结构。本发明提供的船舶轴段进舱导向工装，避免了轴段进舱时由于没有有效支撑导致轴段处于“悬臂梁”状态；降低了对施工人员的技术水平要求，消除了轴段进舱的潜在风险，提高了工作效率和安全系数。