本发明公开了一种清除船底海洋污损生物的方法，在船体底部内侧沿船体纵向铺设调温管道，所述调温管道分为两种：加热管道和冷冻管道，加热管道和冷冻管道间隔布置，冷冻管道与制冷机相连，加热管道与船用热管冷凝器相连；当需要对船底附着的污损生物进行清理时，先启动制冷机，通过冷冻管道对船底进行降温冷冻，使得船底外侧附着的污损生物冰冻起来，然后关闭制冷机，并开启船用热管冷凝器开关，通过加热管道对船底进行加热，使得船底外侧被冰冻起来的污损生物慢慢融化，由于被冰冻起来的污损生物从其与船底接触的部位开始融化，在海流的冲刷作用下，污损生物便会自动脱离船底。本发明方法简单，操作便捷，节约能源，清污效果好。