本发明公开了一种对深海表层水连续取样的科考船，包括船体，在船体的船舷处设置有一用于对水面以下的表层水进行连续取样的装置，该装置包括沿船舷上下铺设的轨道部件以及设于轨道部件一侧的转动部件，在轨道部件与转动部件之间设置有一可沿船舷上下摆动的取样杆，所述取样杆的一端与转动部件转动连接，另一端与轨道部件滑动连接，在取样杆上固定有一伸至表层水中用于将表层水抽吸取样的取样管，在取样管上设置有避免因船体走航时海水产生持续阻力对取样管造成损坏的缓冲机构。本发明不但有效保证能够准确取到表层水，而且在科考船航行过程中能够实现连续采集。