本发明公开了一种面向不确定条件下的高超声速飞行器的控制方法，包括以下步骤：步骤S1，根据高超声速飞行器纵向动力学方程，对飞行速度V和飞行高度h采用全状态反馈线性化处理，得到其对应的状态方程；步骤S2，根据此状态方程，设计反步滑模控制器，选择滑膜面的双幂次趋近律为：式中，k1＞0,k2＞0,η＞1,1＞λ＞0为参数；步骤S3，基于此反步滑模控制器搭建试验平台，进行性能仿真。本发明方法采用基于反步法的双幂次滑模控制器，该方法可以有效地降低切换增益并消除滑模控制中存在的抖振问题。