本发明涉及工程船吃水装载调控系统，包括中央控制器，以及与中央控制器分别连接的船舶艏左吃水传感器、船舶艏右吃水传感器、船舶舯左吃水传感器、船舶舯右吃水传感器、船舶艉左吃水传感器、船舶艉右吃水传感器，还包括与中央控制器分别连接的船舶艏左吃水调节器、船舶艏中吃水调节器、船舶艏右吃水调节器、船舶艉左吃水调节器、船舶艉中吃水调节器、船舶艉右吃水调节器，其中所述中央控制器包括可靠性判断部、模糊模拟分析部、优先控制判定部以及控制指令发送部；根据传感器实时检测数据，调节精度高，调节时效好，调节后船身吃水平稳，运行及作业稳定。