本发明公开了一种应用于超导磁悬浮微小推力测量系统的特种超导体低温冷却结构设计，包括制冷机、冷却底座、冷却铜柱、冷却铜环、超导定子阵列、Al2O3陶瓷盖板、铟片、石墨垫片和防辐射屏等。针对测量系统冷却结构的高冷却效率和低涡流损耗要求，设计涡流效应小的双通路传导冷却结构。该冷却结构在各部分的接触面上均设有减小接触热阻的导热垫片，并且通过设置防辐射屏隔绝外界的辐射热流。测量系统工作时，涡流效应微弱的Al2O3陶瓷盖板和石墨垫片处于磁场变化剧烈区域，而涡流效应明显的冷却底座、冷却铜环和冷却铜柱与该区域相隔离，这种传导冷却结构布局抑制了传导冷却结构的涡流损耗。