本发明公开了一种电动自行车的控制系统，涉及电动自行车的电池领域，解决电动自行车车主在非官方指定修车店更换到劣质电瓶的问题。本发明包括电动自行车电池，其特征在于，还包括处理单元、电门锁、解码仪和控制器；其中，所述电动自行车电池的数字电源端连接处理单元的电平输入端，所述电门锁的信号输出端连接处理单元的信号输入端，所述解码仪的信号输出端连接处理单元的信号输入端，所述控制器的信号输入端连接处理单元的信号输出端。本发明具有提醒车主主动思考在该店更换的电瓶是否是劣质电瓶，从而引导车主到指定地点更换合格的电瓶以及防盗等优点。