本发明公开了一种有源纹波抑制型并网变流器及其控制方法。该变流器主电路拓扑包括直流电源、输入电容、原边开关管、原边二极管、辅助开关管、辅助二极管、解耦电容、隔离变压器、副边开关管、副边二极管、滤波电路及电网；其控制方法为：解耦电容电压采样值经过电压环获得其电压扰动信号，输入电压和电流采样值经过输入电流基准电路获得输入电流基准，电网电压采样值经过PLL获得与其同频同相的单位正弦波，然后通过基准生成模块、调制波生成模块、比较器、逻辑电路获得开关管驱动信号。本发明通过控制增加的有源辅助电路实现了直流输入侧功率纹波的有效抑制，同时实现并网。