本发明属于车载复合电源的能量管理领域，具体为一种重型商用车EPS复合电源的多模式能量管理方法，包括发电机定功率模式、寻优模式1、超级电容强制充电模式、超级电容待充电模式和寻优模式五种工作模式，在确定工作模式切换参数、发电机最优工作区间以及超级电容的临界电压基础上，由控制器判定复合电源的工作模式并确定发电机和超级电容的功率分配。本发明可以实时分配发电机的输出功率与超级电容的充放电功率，并且在支持EPS在重型商用车中的应用的同时可以尽可能的使发电机工作在其最优工作区间，从而实现高效的应用发电机与超级电容的输出功率。