本实用新型属于医疗器械技术领域，具体涉及一种无菌包运输系统，包括运输车、传递窗和电梯厢，运输车包括侧面设有箱门的运输箱和板车，拉杆自由端倾斜设有C形卡块，两个C形卡块上卡设有横杆，板车于拉杆对应一端还设有两个第一凸块，第一凸块上开设有第一通孔，运输箱外壁于第一凸块对应位置设有第二凸块，通槽内穿设有U字形固定块，U字形固定块端部与十字卡块相匹配，U字形固定块上还连接有联动杆，联动杆穿过板车于板车前端连接有把手，传递窗于第一槽口内固定设有第一凸柱，第一凸柱与定位板相匹配，传递窗内还设有与第一凸棱横截面结构和尺寸相同的第二凸棱。其目的是：用来解决现有的无菌包运输方式导致的易污染和效率低下的问题。