本发明提供一种基于飞机中轴线重合的机身对接调姿方法，步骤如下：1)结合装配工艺与机身结构，提取机身上沿中性面具有对称关系的关键点；2)拟合机身中性面实际位置参数，并通过坐标转换与目标中性面重合；3)在目标中性面上建立二维坐标系，并求取与三维坐标系的转换关系；4)在保持中性面不变的基础上，根据最小二乘法建立机身交点孔对接匹配目标函数，采用遗传算法获得大部件位姿调整向量。通过以上步骤，能够保证中、后机身对接时，解决了对接过程中性面不重合的问题，提高了部段的整体对合精度；针对无法测量的关键特征，可通过中性面重合得到转换，提高关键特征的对接装配精度。