本发明公开一种用于海洋水体自动采集的长航程无人机及其控制方法。用于海洋水体自动采集的长航程无人机包括：无人机本体，无人机本体包括飞控模块及机身，飞控模块固定于机身内部，飞控模块用于规划航线，控制机身自动以多旋翼模式起降，和/或控制机身自动由多旋翼模式切换至固定翼模式后飞行；取水装置，设置于机身底部，飞控模块与取水装置电连接；测距装置，设置于机身底部，飞控模块与测距装置电连接。本发明将取水装置、测距装置集成于无人机本体上，通过飞控模块，实现海洋水体采集全程高度自动化，解决了现有技术中取水装置及测距装置的集成程度低、自动化程度低而导致需要更多的人员、设备进行操作控制、效率低下及航程短的问题。