本发明公开了一种仿蝴蝶微型扑翼飞行器，包括机架，扑动机构与机翼；机架用于安装扑动机构、驱动器与机身连杆；扑动机构为双曲柄双摇杆机构，包含主轴齿轮，传动齿轮及连杆、摇杆等，主轴齿轮驱动传动齿轮转动，连杆将齿轮的转动转化为摇杆的摆动，实现扑动；第一、第二级机翼与摇杆连接，随摇杆上下扑动产生升力，其中第二机翼与第一机翼绞接，除了随第一机翼扑动之外，还可翻转实现姿态控制。本发明在简单紧凑的结构中实现了翅翼的整体扑动及尾缘的偏转，实现飞行器前进、滚转、上升、下降等复杂运动的控制。