本发明实施例提供一种空间激光干涉引力波探测器轨道修正方法及系统，包括：获取空间激光干涉引力波探测器名义轨道要素和实际轨道要素，计算获得空间激光干涉引力波探测器的平均轨道要素偏差值；获取空间激光干涉引力波探测器名义轨道要素，以及空间激光干涉引力波探测器的摄动量级信息，计算获得空间激光干涉引力波探测器的平均轨道要素摄动方程；根据虚拟编队构型包络半径和空间激光干涉引力波探测器轨道构型稳定性指标之间的几何关系，结合平均轨道要素摄动方程，得到空间激光干涉引力波探测器平均轨道要素偏差值的期望值，进而计算获得空间激光干涉引力波探测器的平均轨道要素修正量。本发明提供的方法，可以减小燃料消耗、延长任务寿命。