本发明公开了一种流向变换式耗氧型惰化系统，涉及航空系统技术领域。本发明的具体原理为：将燃油箱上部的易燃易爆的燃油蒸汽混合物通过风机加热后引入催化反应器的进口，燃油蒸汽混合物在反应器中发生化学反应，燃油蒸汽被分解成水和二氧化碳，氧气被消耗；反应后的富氮气体通过冷却除水后返回油箱，对油箱进行惰化。反应器内部两端设由保温材料可以储存化学反应热，进出口处设由温度传感器，当反应器出口温度过高时，由反应器两端的三通阀在自动控制器的控制下实现流向变换操作，避免反应器飞温。因此该系统启动后，无需对燃油蒸汽混合物进行预热，具有温度自控、自热等优点。