本发明公开了一种基于低轨卫星的空间碎片批量清除系统，包括低轨卫星以及碎片清除机构，碎片清除机构包括总控制系统、投放装置、跟瞄装置以及多个不同类型的捕获装置，碎片清除机构安装在所述低轨卫星的搭载平台上，所述低轨卫星装载所述碎片清除机构进入轨道，捕获装置由投放装置推射进入不同空间碎片的转移轨道，捕获装置包括网捕组件、降轨过程以及能控制网捕组件和降轨组件运行的捕获控制系统，跟瞄装置获取目标碎片的位置参数并传输至总控制系统，总控制系统根据预设程序进行计算并输出控制指令至投放装置以及捕获控制系统。所述清除系统及其清除方法的捕获装置体积小、质量轻，高度模块化、标准化，成本低，可大量投放，捕获效率高。