一种平流层飞艇电机控制数据传输方法，步骤如下：1、控制计算机110判断控制计算机110、数据收发器140、数据收发器350、电机控制处理器组成的通信链路是否正常；如通信链路出现故障，控制计算机110将控制数据发送至线序切换模块130；2、线序切换模块130根据控制计算机110发出的控制数据改变电源电缆200中线缆201和线缆202的正负极状态；3、线序状态检测电路310检测电源电缆200中线缆201和线缆202的正负极状态，将对应的控制数据发送至电机控制处理器340；4、电机控制处理器340将线序状态检测电路310的控制数据处理后传递给电机功率模块；5、整流模块320将线缆201和线缆202中依据控制数据变化的极性变化的电源转换为供电机功率模块330使用的极性固定的电源。