本发明属于核电厂系统调试与运行技术领域，具体涉及一种核电厂闭式冷却水泵小流量运行保护装置。第一闭式冷却水泵组从第一闭式冷却水泵入口隔离阀起，依次串联布置第一闭式冷却水泵入口过滤器、第一闭式冷却水泵、第一闭式冷却水泵出口止回阀、第一闭式冷却水泵出口调节阀；第一闭式冷却水泵组从储液箱吸取闭式冷却水，依次经过第一闭式冷却水换热器、闭式冷却水系统用户后，返回储液箱，形成闭式循环；第一闭式冷却水泵小流量管线，自第一闭式冷却水泵出口调节阀出口侧起，依次串联布置第一小流量止回阀、第一小流量调节阀，然后与储液箱连接。本发明结构简单、操作便捷，并能使闭式冷却水泵满足电厂各类工况要求。