本发明公布了一种变速永磁交流发电机系统及其稳压控制方法。本发明的系统包括永磁交流发电机、PWM整流器、直流滤波装置以及控制器，控制器包括转子位置检测模块、直流电压检测模块、交流电流检测模块、坐标变换模块、电压环调节器、电流限幅模块、交轴单电流环调节器及PWM调制模块。本发明的方法包括步骤：采集发电机转子位置和转速、直流电压、交流电流，经坐标变换获得交轴电流，以稳定直流电压为目标经闭环控制产生交直轴电压给定值并对直轴电流限幅，产生PWM触发脉冲控制PWM整流器。本发明在发电机高转速运行且转速变化时维持输出的直流电压稳定，且动态响应快，方法简单，可靠性高。