本发明公开一种基于光子晶体光纤结构二维定位孔的毛细玻璃管堆积装置，包括两个定位板；两个定位板相互平行设置，且两个定位板上开有相互对称的光纤穿孔。上述两个定位板相对侧面的外缘处对应位置还分别设计有定位销与定位孔，保证了两个定位板间的对称性。使用时，将毛细管插入两个定位板上的光纤通孔，将合两个定位板逐渐分开，移动至毛细管两端，在移动过程中可以根据实际操作过程中，逐步固定，之后用金属丝等将预制棒两端捆紧，将装置从两端取出即可。本发明方便易操作，对操作人员要求低，并且采用此装置堆积的预制棒一致性好，大大提高了预制棒制作效率。