本发明公开了一种石墨舟清洗工艺，包括以下步骤：S1、准备需要清洗的石墨舟，进行拆舟处理，将工艺卡点单独放置清洗；S2、配备清洗液，所配置的氢氟酸的质量浓度比为10％‑15％；S3、将拆卸的石墨舟放进清洗液中进行酸洗浸泡，浸泡时间为8‑12h,浸泡的过程中打开喷淋阀门和鼓泡机；S4、将浸泡后的石墨舟放进纯水中进行漂洗，放置纯水池中浸泡2‑3h，纯水漂洗过程中打开鼓泡机和喷淋阀门；S5、检验在纯水中石墨舟清洗的流动水的酸碱度。本发明将石墨舟拆分清洁，清洗过程多为浸泡，减小了对石墨舟表面的冲击，延长了使用的寿命，采用超声波清洁，使清洁更加彻底，且清洁过程中保证减少对舟体的伤害，适合市场进行推广。