本发明涉及盾构掘进方法领域，特别是一种海底基岩凸起段的掘进方法。旨在解决现有技术中盾构掘进过程中，海底基岩凸起段施工困难的问题。本发明包括勘探、钻孔、加工、掘进等步骤，对于海中的硬岩凸起段，采用海上对硬岩上部地层进行三轴搅拌或高压旋喷加固，刀盘等配套设备同时做出改变。优点在于：解决了海底基岩凸起段的掘进难题，各个工步间相互结合后，有着优异的防渗漏效果。