本发明公开了一种多联装二维扇束计算机层析成像方法，步骤为：(1)将多个物体放置于多联装CT检台，进行单圆轨道扇束CT扫描，获得一幅二维投影图像；(2)对步骤(1)中投影图像进行对数解调，获得一幅线积分二维图像；(3)计算每个物体扇束线积分在步骤(2)线积分二维图像中的对应位置参数；(4)利用步骤(3)计算出的位置参数，分割步骤(2)中线积分二维图像，获得每个物体的扇束线积分二维子图像；(5)将代数重建技术分别应用于步骤(4)中每个物体的扇束线积分二维子图像，生成每个物体的二维CT图像。本发明在不增加透照厚度情况下，可大幅提高成像效率，同时避免射束硬化、散射及信号串扰因素，实现过程简单、高效，精度高。