本发明公开了一种生成低碰撞区跳频序列集的方法，解决了现有技术中需要对不同移位后的序列进行同时存储，然后通过交织技术的原理进行不同移位后的序列间的读取，所需的软硬件存储空间还是运算复杂度都较大的问题。本发明包括当载波频带范围内的频隙个数为素数次幂时，构建低碰撞区跳频序列集并为每个用户分配跳频序列。本发明不需要对多条移位后的序列同时存储后进行交织再按列读取，实现方法简单，所需的软硬件存储空间较小。