本申请提供一种高速量子密钥编码装置及编码方法，涉及量子通信技术领域，所述编码装置包括第一信号光源、第二信号光源、不等臂干涉仪、第一相位调制器、强度调制器、第四分束器；所述第一信号光源与所述不等臂干涉仪依次串联，所述第二信号光源与所述强度调制器依次串联，所述第四分束器包括两个输入端和一个输出端，所述不等臂干涉仪与所述第四分束器的一个输入端连接，所述强度调制器与所述第四分束器的另一个输入端连接；所述不等臂干涉仪包括长臂与短臂，所述第一相位调制器设置于所述长臂或短臂；所述第一信号光源、第二信号光源、第一相位调制器、强度调制器的驱动信号频率大小相同。本申请能以高精度实现超过吉赫兹的高速量子密钥编码。