一种抗菌玻璃纤维复合过滤纸，包含上玻璃纤维层、下玻璃纤维层和吸附层三层结构，其特征在于所述的复合过滤纸吸附层在上玻璃纤维层和下玻璃纤维层之间，吸附层厚度为0.005～0.015mm，所述的上玻璃纤维层、下玻璃纤维层和吸附层纤维表面都浸渍有抗菌涂层。本发明还公开了一种抗菌玻璃纤维复合过滤纸的制备方法，其特征在于包括以下步骤：(1)打浆池分散制浆；(2)湿法成型；(3)抄纸成型；(4)浸渍抗菌涂层；(5)热压干燥。本发明所具有的有益效果是：①工艺简单；②制备产品性能优异；③抗菌效果优异。