本发明公开了一种船舶侦测跟踪系统，包括：终端、控制单元、侦测设备和联动设备；所述终端和控制单元的一端连接，所述侦测设备、联动设备均和控制单元的另一端连接；所述侦测设备，用于采集预设区域内的目标信息，并将目标信息发送至控制单元；所述联动设备，用于对可疑船舶进行视频跟踪和拍照；所述控制单元，用于处理所述目标信息，根据处理的目标信息判断是否存在可疑船舶；并控制联动设备对可疑船舶视频跟踪；本发明采用岸基雷达及AIS侦测船舶，通过控制单元分析处理后，对存在风险的船舶进行自动视频追踪、拍照和轨迹回放，使得用户可以及时处理风险，减少损失。