本发明公开了一种用于无人机编队飞行的控制系统，包括一个长机编队控制装置、多个僚机编队控制装置和一个地面装置。所述长机编队控制器包括：卫星导航模块、地面站通讯电台接口、编队通讯电台接口、GNSS接口、GCS（Ground Control Station）接口和一套长机编队控制器软件；所述僚机编队控制装置包括：僚机编队控制器、僚机自动驾驶仪和僚机编队通讯电台；所述僚机编队控制器包括：卫星导航模块、编队通讯电台接口、SBUS接口、GNSS接口、GCS（Ground Control Station）接口和一套僚机编队控制器软件；所述地面装置包括地面控制站和地面差分基站，地面控制站与地面通讯电台连接，地面差分基站与地面差分电台相连。