本发明提供了中间件业务故障处理方法及系统，前者包括S1：将来自不同应用系统的业务数据通过中间件发送至监控系统，以对所述业务数据进行监控；S2：设置承担故障处理的管理节点，选取管理节点中的一个作为主节点，其余作为备节点；S3：并判断是否出现故障，若是，监控系统通知消息中间件服务模块向主节点的管理中心服务模块发送故障消息等。本发明利用消息中间件以及单节点监控程序组成一个覆盖整个计算机集群系统节点的监控网络，实时监控每个节点的服务状态以及网络状态；通过计算响应时间和业务量的可信区间以及业务效率基线值；确定服务效率差的中间件链路的业务量和平均响应时间是否偏离业务效率基线值，根据确认结果重置中间件链路。