本发明公开了一种多区块链的跨链数据处理方法和系统，所述系统包括：一个主链，包括：主链验证节点、主链收集者节点、主链观察者节点；多个子链，每个子链包括：子链验证节点、子链收集者节点、子链观察者节点；其中，所述主链验证节点用于参与主链验证，所述主链收集者节点用于接收子链区块提案，所述主链观察者节点用于同步主链的区块状态，所述子链验证节点用于参与主链与相关子链的共识，所述子链收集者节点用于监测区块的产生并提交子链区块提案给主链收集者节点，所述子链观察者节点用于同步子链的区块状态。本发明为不同业务创建差异化特征子链，并依靠主链进行更高层次的共识验证，在不降低安全性的前提下，提升区块链处理性能，并满足业务的多样性诉求。