一种基于ARM和FLASH的FPGA重配置系统，该系统包括上位机软件、嵌入式控制器即ARM、Flash存储器、显示控制电路和被测FPGA即DUT；所有连接汇总到嵌入式控制器之中，通过手动控制和上位机的操作，实现嵌入式控制器和被测FPGA、Flash的双向通讯，进而实现FPGA的老炼重配置；本发明可以实现FPGA的手动和自动重配置，通过切换配置电路对FPGA进行多次配置和老炼，可以保证比较高的资源覆盖率。通过将连线资源分类进行多次配置和老炼，基本能够实现连线资源的全覆盖老炼。