本发明公开了一种通用可配置MSK或QPSK直序扩频调制系统及方法，其中，所述输出速率控制模块(1)通过多级联计数器实现扩频速率控制；所述数据流控制模块(2)实现按扩频速率形成基带数据流；所述MSK/QPSK复用扩频过程模块(3)完成差分编码、串并转换、扩频码映射和星座图映射等扩频功能；MSK模式下扩频数据流经过所述NCO混频模块(4)输出调制结果，QPSK模式下扩频数据流经过所述成型滤波模块输出或直接输出调制结果。本发明能可选实现QPSK或MSK扩频调制运算，且码速率、PN码长度内容等均可动态配置，避免重复设计。