本发明公开了一种基于FPGA的卫星导航信号模拟方法和模拟系统。模拟方法包括：对输入的系统参数和通道参数进行接收和存储，并间隔发出中断信号控制外部输入数据的更新；控制相位产生电文、伪码、子码、载波和子载波并调制输出数字中频信号。本发明具有如下优点：基于FPGA搭建，可模拟实时、高精度、高动态的卫星导航信号；各个功能模块之间相互独立，易于维护和系统升级；频点信息和参数来自外部输入，调制工程依据频点和参数信息对调制工程进行配置，可实现特定频点的信号调制；调制工程兼容BDS、GPS、GLONASS和GALILEO卫导系统的各个频点，满足新型信号体制对模拟器提出的新要求。