本发明公开了一种人机交互式多功能FPGA符合测量系统及其测量方法，属于电子技术应用领域，可直接在上位机应用程序中实现通道选择、符合窗口设置、数据延迟设置、采集时间、单次数据采集或连续数据采集、数据延迟扫描与校准、数据显示、数据保存和界面参数保存等功能；提出符合窗口调整法和混合时延测量法，实现延迟自动化测量和校准，避免反复人工加减延迟线和调控时钟导致的信号不稳定；集成通道选择系统和符合数据处理系统，实现软件上对通道的选择，并能实时采集和保存数据，其次符合操作中设计并行处理算法，提高运算速度；内部设计数十个符合测量模块，可同时进行多种类符合操作。本发明扩展性好，符合计数效率高，移植性和鲁棒性强。