本发明公开了一种适用于宇航通信的速率自适应型LDPC译码器，包括：输入数据处理模块、迭代译码模块和输出数据处理模块，输入数据处理模块包括帧同步检测单元、FIFO存储器和空帧填充单元，数据流输入帧同步检测单元，帧同步检测单元对数据做帧同步检测，并将同步的数据帧送入FIFO存储器，根据FIFO存储器的满状态标记和空状态标记，空帧填充单元从FIFO存储器读取数据帧或填充空帧送入迭代译码模块；经迭代译码模块译码后，输出数据处理模块对迭代译码后的数据做硬判决并组帧输出。本发明通过对输入数据填充空帧，实现单一主时钟自适应处理不同速率数据的译码运算。