本发明提供一种地基增强系统的完好性评估方法，包括：根据至少三个参考接收机和至少四个测距源的工作状态，采集地基增强系统的定位误差样本和保护级样本，利用所述保护级样本对定位误差样本进行处理，获得地基增强系统的安全系数样本，组成安全系数序列，对安全系数序列的分布进行估计，获得安全系数序列的完好性风险估计值，最后将完好性风险估计值与地基增强系统性能标准中分配的完好性风险告警值进行比较，得到地基增强系统的完好性评估结果。本发明提供的地基增强系统的完好性评估方法从体制上简化并精确了保护级的完好性评估结果，实现了地基增强系统的完好性评估。