本发明提出了一种NAVDAT中基于双对角线结构的LDPC信道编码方法，该方法包括如下步骤：(1)在NAVDAT发送端，根据校验约束条件，计算校验矩阵母矩阵H的信息块Hs与信息位S的乘积v0,v1,...,vm‑1，并将所有v值累加计算出校验位的第一位P0；(2)根据校验矩阵母矩阵H的特征，将校验位第一位P0和H的校验块Hp第一列特殊行的值相乘，为计算剩余校验位做准备；(3)根据校验位和v之间的关系求出剩余各校验位P1,P2,...,Pm‑1；(4)将信息位和校验位组合成最终的编码序列；本发明充分利用了具有双对角线结构的校验矩阵的母矩阵的特性，利用该数学特征，可以非常有效地简化编码的复杂度，进一步提高编码效率，使其在实际应用中更具备优势。