本实用新型公开多通道模数转换系统，包括数据采集模块、数据处理模块、时钟电路模块、电源电路模块和整板配置模块，其中，所述的数据处理模块包括一现场可编程门阵列和一信号处理器；所述的数据采集模块通过模数转换器支持的高速数据传输标准接口与现场可编程门阵列相连接；所述的数据采集模块包括若干个模数转换器，其若干个模数转换器在同频同相的时钟驱动下工作，并同时进行复位；所述的整板配置模块分别控制电源电路模块中电源的启动顺序；时钟电路模块中时钟的输出频率、输出相位以及输出开关，并可进行复位控制；数据处理模块的启动上电顺序；本实用新型实现了各通道间数据采样同步和数据传输同步，确保所有通道间对模拟采样信号的相位一致性。