本发明公开了一种分数频率综合器频率校准方法、校准电路与频率综合器，校准方法包括：初始化操作：设置临界值；分别获取相对频率比较过程和频率误差检测过程对应的参考时钟信号的周期个数；设置待校准的目标频率；判断当前频率与目标频率的偏移量幅值是否达到临界值，若是，则根据偏移量搜寻下一次比较的频率子带，并对计数器和比较器进行复位；若否，则计算当前频率子带与目标频率的偏移误差量，更新当前最优频率误差的子带控制字，并根据偏移误差量搜寻下一次比较的频率子带；循环执行下一次比较，直至搜寻完所有位宽，输出当前最优频率误差的子带控制字，完成频率校准。本发明的频率校准方法速度快、精度高、适用于宽带多位宽分数频率综合器。