本发明公开一种矩形进口二元高超声速变几何进气道、其设计方法以及工作方法，在传统矩形截面高超声速进气道结构基础上设计并安装可转动的可调顶板，根据飞行器飞行条件调节可调顶板角度位置。可调顶板小角度旋转形成前后两处抽吸窗口，前缘设计在末级顶板前缘处，后缘设计在可调顶板与喉道连接处。在加速过程的低马赫数时利用简单的转动，抽掉前体发展来的附面层，转动同时减小末级楔角角度，减弱激波的同时提高流量捕获，且内收缩段进口马赫数相对增大，有利于提高进气道的起动性能。通过喉道抽吸提高进气道内压段起动性能。小角度转动的变几何过程更易实现，提高了低马赫数条件下的起动性能，对流动的控制更全面，综合改善了进气道的气动性能。