本发明公开一种用于可组态的模拟到数字转换器的控制系统和方法。一种用于模拟到数字转换器(ADC)的控制系统，包含可编程组态存储器、触发选择器、输入选择器和转换控制器。ADC可组态以用于调整包含速度和准确度的多个操作参数。可编程组态存储器存储至少一个组态变量和输入值。触发选择器启用至少一个触发输入。输入选择器根据所编程输入值从多个模拟输入当中进行选择。转换控制器使用所述组态变量组态所述ADC，介接所述输入选择器以将模拟输入提供到ADC，且介接所述触发选择器以提示所述ADC响应于所启用触发输入而执行转换处理以提供数字输出样本。可存储各自选择不同模拟输入和对应组态变量的多个条目，其中所述转换控制器在转换之间动态地重新组态所述ADC。