本发明提供一种分布式POS用数据处理计算机系统实时导航方法，首先，采用基于PPS实时标定与分频的时间同步方法实现三个IMU原始数据的同时刻采集；其次，将主IMU数据与GPS数据融合得出主POS实时导航结果；子IMU采用基于惯性矢量二次积分的解析对准方法完成摇摆基座初始对准，并采用基于多级杆臂补偿的卡尔曼滤波方法完成分布式POS传递对准，得到子IMU实时导航结果以及主/子IMU之间的相对空间关系；本发明实现一主两子分布式POS实时数据处理，适用于高精度分布式惯性测量、导航及组合导航系统。